Swansea podpisała kontrakt z pomocnikiem Valencii wykładając za niego 5.55mln funtów, co było swego czasu klubowym rekordem. Zawodnik podpisał z the Swans 3 letni kontrakt.

Hernandez jest produktem szkółki piłkarskiej w Walencji, a swój debiut w pierwszym zespole zaliczył w sezonie 2006/7.

Następny sezon spędził na wypożyczeniu w Cadiz, gdzie w 22 meczach strzelił 4 bramki.

Valencia sprzedała Hernandeza do Getafe które prowadził Michael Laudrup. Zespół zagrał w finale Pucharu Króla właśnie z Valencią i ta potem odkupiła swojego wychowanka i podpisała z nim 6 letni kontrakt.

W sezonie 2011/12 Hernandez zagrał w 40 meczach Valencii i zdobył 5 bramek, czym przyczynił się do zajęcia trzeciej pozycji w lidze.

W Swansea City zadebiutował w meczu z Aston Villą we wrześniu 2012, a pierwszą bramkę zdobył przeciwko Wigan w październiku.  W sezonie 12/13 w 36 występach zdobył 4 bramki dla Swans.